Con trai:[2]

• Lê Quán Chi, quan đến Ngự tiền Thiết Đột quân, tặng Quan nội hầu. Năm 1449, Lê Quán Chi tụ tập đánh giết người giữa chợ, bị hạ ngục. Vụ án liên quan đến hơn 10 người là con cái quan viên cấp cao trong triều. Dự kiến Quán Chi phải bị xử tử, nhưng Thái hậu sợ Lê Khuyển đau lòng, làm trái pháp luật mà tha cho. Gián quan Lê Lâm ngậm miệng không dám nói. Trẻ con ở chợ lưu truyền câu: Tiếc ta không được làm quan đài thôi![4]
• Lê Công Sảng, Điện tiền Đô chỉ huy sứ, Tri Ngự tiền Hải Kình, Hải Mã, Hải Thu, Hải Điểu; lấy Lê Ngọc Vi, con gái Lê Thụ.
• Lê Công Đình, Lê Khắc Tốn, Lê Công Độ, Lê Hữu Mục, Lê Tư Đạo, Lê Toàn Mỹ, Lê Trực Hữu, khi Lê Khuyển mất vẫn chưa đủ tuổi làm quan.

Con gái, tổng cộng 13 người:[2]

• Lê Ngọc Phương, gả cho con của Tổng tri quân kỵ vệ chư quân sự, Tham tri chính sự, Nhập nội Tư mã, Á hầu Nguyễn Lộ (em trai của Thái hậu).
• Lê Ngọc Phi, gả cho Nhập nội thị sảnh Phó Đô sứ tri Tả ban Lê Hoằng Lưu, con trai Thái phó Lê Văn Linh.
• Lê Ngọc Chi, gả cho Điện tiền Đô Chỉ huy phó sứ Tri Ngự tiền Chấn Lôi quân (không rõ tên), con trai của Thái phó Lê Nhữ Lãm.
• Lê Ngọc Liên, gả cho Đồng tri Ngự tiền Thị vệ quân (không rõ tên), con trai của Đại tư đồ Lê Thận.
• Lê Ngọc Chỉ, gả cho Trịnh Công Mục, con trai của Liệt hầu Lê Khả.
• Lê Ngọc Sót, Quận phu nhân.
• Lê Ngọc Chi, Quận phu nhân.